【中國綠色時(shí)報(bào)】林木表型組學(xué),智慧林業(yè)的前沿探索
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林木表型組學(xué)是研究林木表型的一門新興的生物學(xué)學(xué)科。表型組是指某一生物的全部性狀特征。表型組學(xué)是一門在基因水平上系統(tǒng)研究某一生物或細(xì)胞在各種不同環(huán)境條件下所有表型的學(xué)科。這一學(xué)科強(qiáng)調(diào)基因、時(shí)間和環(huán)境因素之間的互動(dòng),并且關(guān)注表型的多維度和多樣性。
林木表型組學(xué),就是研究樹木的所有外在特征的學(xué)科。就像人有不同的身高、發(fā)色,樹木也有不同的高度、枝條形狀等特征。這個(gè)學(xué)科通過觀察樹木在不同環(huán)境下的這些特征,來理解它們是怎樣生長、如何適應(yīng)環(huán)境的。例如,研究一棵松樹在干旱和濕潤環(huán)境下,冠層和樹形是如何變化的,這對(duì)于選擇更適合特定環(huán)境的品種、提高林木的生長質(zhì)量都很有幫助。簡(jiǎn)單來說,林木表型組學(xué)就像是研究樹木的“體檢報(bào)告”,能幫助我們更好地了解和利用森林資源。
技術(shù)革新將林業(yè)帶入“精準(zhǔn)”行業(yè)
隨著林草大數(shù)據(jù)等領(lǐng)域技術(shù)革新,未來林業(yè)聚焦三大熱點(diǎn)方向,其中新一代林木育種技術(shù)研究和“智慧林業(yè)”應(yīng)用研究,這兩大方向都離不開表型組學(xué)的應(yīng)用。中國林科院亞熱帶林業(yè)研究所近年來持續(xù)推動(dòng)新興學(xué)科發(fā)展,在“十四五”規(guī)劃中,將智慧林業(yè)發(fā)展列為四大重點(diǎn)工程之一,其中表型組學(xué)扮演著關(guān)鍵角色。
近日,亞林所林木種質(zhì)資源研究團(tuán)隊(duì)利用高通量遙感無人機(jī),精準(zhǔn)估算了濕地松育種群體單株樹高、林冠面積及其葉綠素含量,為林木育種培育領(lǐng)域大樹生長和生理性狀測(cè)定提供了機(jī)器換人、高效規(guī)范的解決方案。研究成果發(fā)表在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)核心技術(shù)領(lǐng)域國際期刊《精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)》上,這標(biāo)志著林業(yè)也進(jìn)入“精準(zhǔn)”行業(yè)。
林木種質(zhì)資源研究團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人欒啟福研究員說,團(tuán)隊(duì)長期從事亞熱帶主要用材和生態(tài)樹種資源收集、評(píng)價(jià)及其新種質(zhì)創(chuàng)建和良種的推廣工作,幾十年來營建試驗(yàn)示范林近萬畝。種質(zhì)調(diào)查和評(píng)價(jià)是最核心的工作,也是最棘手的工作,特別是大量樹高10—20米、漫山遍野的濕地松等重要工業(yè)原料試驗(yàn)示范林的生長生理評(píng)價(jià)長期滯后,影響到各項(xiàng)試驗(yàn)研究、良種選育的進(jìn)程。團(tuán)隊(duì)研發(fā)了基于無人機(jī)的濕地松生長生理評(píng)價(jià)技術(shù),為解決這個(gè)問題提供了新的途徑。
林木表型組學(xué)發(fā)展加快林木育種進(jìn)程
為提升數(shù)據(jù)處理的效率和精確度,亞林所林木種質(zhì)資源研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了如林木光譜提取工具(ExtSpecR)和新抽梢智能計(jì)算工具(CountShoots)等軟件。通過改進(jìn)的輕量級(jí)實(shí)時(shí)目標(biāo)檢測(cè)(YOLOX)模型和濕地松抽梢計(jì)數(shù)網(wǎng)絡(luò)(SPSC-net)模型,突破了單樹形態(tài)及光譜數(shù)據(jù)提取的技術(shù)難題,為林木育種效率的提升和表型—基因型關(guān)聯(lián)分析提供了有力的工具。這些研究成果不僅在《植物表型組學(xué)》等表型組學(xué)領(lǐng)域的主流期刊上發(fā)表了多篇SCI論文,還受到了國內(nèi)外專家的廣泛關(guān)注和肯定。
團(tuán)隊(duì)成員李彥杰副研究員表示,植物表型組學(xué)在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域已經(jīng)顯示出顯著的應(yīng)用價(jià)值。目前,多種室內(nèi)外表型平臺(tái)已經(jīng)在農(nóng)業(yè)中得到廣泛應(yīng)用。這些平臺(tái)顯著提高了作物表型特征的測(cè)量效率和準(zhǔn)確度,為理解植物對(duì)特定環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制提供了重要的研究工具。然而,專門用于林木的室內(nèi)外表型平臺(tái),尤其是服務(wù)于林木遺傳育種的平臺(tái)相對(duì)較少。林木表型組學(xué)是一個(gè)充滿潛力的領(lǐng)域,是加快林木育種進(jìn)程、縮短育種周期的強(qiáng)大工具,團(tuán)隊(duì)在這些前沿科技上的探索和突破充分體現(xiàn)了團(tuán)隊(duì)在林木表型組學(xué)領(lǐng)域的領(lǐng)先地位和創(chuàng)新能力。
交叉融合推動(dòng)數(shù)字化林業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)
亞林所自1964年成立以來,一直致力于生態(tài)保護(hù)、森林資源培育和經(jīng)濟(jì)林領(lǐng)域的科學(xué)研究。在過去的60年里,亞林所在傳統(tǒng)林業(yè)育種和林木資源管理方面取得了顯著的成效。隨著科技不斷發(fā)展,亞林所正積極推進(jìn)高新技術(shù)與林業(yè)研究的深度融合,尤其在表型組學(xué)領(lǐng)域,以促進(jìn)林業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型升級(jí)。
近日,隨著亞林所建所60周年系列學(xué)術(shù)活動(dòng)之 “聚焦林木表型組學(xué),共話智慧林業(yè)發(fā)展”首屆林木表型組學(xué)前沿論壇的舉辦,亞林所在推動(dòng)林業(yè)科技創(chuàng)新和智慧林業(yè)管理方面邁出了重要一步。論壇上,來自國內(nèi)多所科研院校的專家學(xué)者交流了林木三維表型技術(shù)、氣候變化下的林木表型研究、高光譜遙感檢測(cè)、林木病害監(jiān)測(cè)等多個(gè)領(lǐng)域的最新研究成果,探討了林木經(jīng)營管理與信息技術(shù)的新理論和方法,為林業(yè)行業(yè)的數(shù)字化轉(zhuǎn)型提供了新思路和動(dòng)力。
未來,亞林所林木種質(zhì)資源研究團(tuán)隊(duì)將繼續(xù)聚焦智慧林業(yè)學(xué)科發(fā)展,特別是林木表型組學(xué)領(lǐng)域。深化林木種質(zhì)資源研究,通過集成遺傳學(xué)、生態(tài)學(xué)和信息科學(xué)等多學(xué)科技術(shù),提升林木表型特征的測(cè)量和分析能力。同時(shí),致力于開發(fā)智能化林業(yè)管理系統(tǒng),加快林業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型的步伐。在生態(tài)保護(hù)、森林資源培育和經(jīng)濟(jì)林等領(lǐng)域開展更多應(yīng)用基礎(chǔ)研究,為國內(nèi)林業(yè)產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展和創(chuàng)新提供科學(xué)支持。
(中國綠色時(shí)報(bào) 作者 李彥杰 楊瑩瑩 2024.02.26 4版)
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